（1）過敏體質者如果注射傷寒、副傷寒、百日咳死疫苗、狂犬疫苗，異種動物血清等制劑后，有可能發生猝死，應慎用。
（2）免疫缺陷病患者不可注射活疫苗制劑。如注射死疫苗或類毒素制劑，雖無危險，但不產生抗體或效果差。
（3）應用免疫抑制劑的患者，只能在停藥2～4周后方可接種活疫菌，但死疫苗、類毒素和抗毒素在用藥期間均可接種。
（4）凡高燒、嚴重心血管疾病、肝病、腎病、活動性肺結核、活動性風濕病、急性傳染病、嚴重高血壓、糖尿病人，均不宜接種，以防疾病惡化。
（5）孕婦也不宜注射、以防流產或早產。另外，婦女經期可暫緩注射。
（6）濕疹或其他嚴重皮膚病患者不宜接種牛痘苗。
但免疫接種禁忌也不可絕對化，在確須接種時，可采取下列措施：（1）進行被動免疫接種；（2）稀釋后可小劑量多次注射；（3）于注射前兩日服用抗組胺藥；（4）注射前先進行皮膚檢查。
