科托努國際機場可起降波音747和空中客車等大型飛機。現有法國航空公司、布魯塞爾航空公司、埃塞俄比亞航空公司、土耳其航空公司、摩洛哥航空公司、科特迪瓦航空公司、盧旺達航空公司、毛里塔尼亞航空公司、Asky等多家航空公司在貝運營，每周有多個班次航班往返巴黎、布魯塞爾及非洲其他地區。中國到貝寧沒有直接航班，一般選擇在法國、比利時、埃塞俄比亞或土耳其轉機。

機場電話：00229-21301413。

貝寧鐵路總長680多公里，其中579公里為主干線。最主要路段連接科托努和帕拉庫，長約440公里，年久失修。

公路總長約15700公里，其中國家級公路約6076公里，二級、三級公路約1800公里，鄉村道路約7800公里。

中國駕照在貝寧不能使用，可憑中國駕照到貝寧交通局換取貝寧當地駕照，在離開貝寧時換回中國駕照。

所有車輛一律靠右側行駛，紅綠燈較少。當地摩托車數量較多，且摩托車主交通安全意識較弱，車速較快，需格外注意安全。

科托努港為地區性重要轉運港口，水深9至15米，可停泊萬噸級輪船。2022年吞吐量約1250萬噸。

貝寧基本無市內公共交通，但“摩的”較流行，價格低廉。出租車業務于2017年7月起開始推行，目前在全國主要大城市，如科托努市、波多諾伏市、塞梅-波吉市、維達市、阿拉達市、波依貢市、阿波美-卡拉維市、帕拉庫市、納迪丹古市等有運營。

科托努（Cotonou）是貝寧政府所在地，位于貝寧南部沿海地區，瀕臨幾內亞灣，北面是諾奎大潟湖，為全國最大港口和第一大城市，也是貝寧的政治、經濟、交通和外貿中心。貝寧的政府機關，各國及國際組織駐貝寧外交機構等，均設在科托努。

波多諾伏（Porto-Novo）是貝寧首都和國民議會及部分政府機構所在地，是貝寧最古老的城市之一，現在仍保留著十分濃厚的古非洲城市的風貌。