南蘇丹歷經多年戰亂，各地小規模沖突時有發生，民間槍支泛濫，各地治安狀況普遍較差，道路伏擊、惡性犯罪事件頻發。2016年7月首都朱巴曾爆發大規模武裝沖突，在南中資企業員工和華僑一度撤離。來南人員應加強安全防范，保持警惕，提高自我保護意識，避免夜間外出，避免前往治安問題高發區域和沖突地區。

南蘇丹氣候分為旱季（約11月至次年4月）和雨季（約5月至10月）。旱季期間，降水量銳減，蝗災、火災多發；雨季期間，降水量較大，尼羅河沿岸地區易發生洪災，易引發滑坡、泥石流等災害。

1972年至2011年間，南蘇丹共發生過67次里氏4.0級以上地震，包括17次里氏5.0級以上地震。地震發生次數最多的是中赤道州，共42起，占總地震數的63%。1990年中赤道州曾發生里氏7.0級地震。2016年7月初，中赤道州發生低烈度地震，有明顯震感。2023年10月31日下午5點35分中赤道州首都朱巴東南62公里處發生5.0級地震，11月13日晚上8點55分南蘇丹與烏干達邊境發生4.9級地震，朱巴有明顯震感。

南蘇丹地處熱帶，熱帶傳染病較多，主要是瘧疾、霍亂、傷寒、痢疾等。其他傳染病包括麥地那龍線蟲病、昏睡病、布魯里潰瘍、血吸蟲病、埃博拉、象皮病及麻風病等。南蘇丹公共衛生條件極差，缺醫少藥，孕產婦及嬰兒死亡率居世界前列。建議來南人員自帶治療瘧疾、驅除蚊蟲的藥物及個人常用藥和蚊帳。入境后，如發現身體不適，出現發燒、肌肉關節酸痛等癥狀，應盡快到當地醫院檢查就醫。南瘧疾、傷寒高發，如不能及時確診，建議采取排除法，先服用自備抗瘧藥。南雨季蚊蠅較多，需格外重視防蚊防疫措施，建議有條件的處所定時組織噴灑滅蚊藥劑。

南蘇丹常年高溫，各類病源微生物繁殖快，食品容易腐敗變質，易引發食物中毒。易腐敗變質的食品以冷葷、涼菜、剩飯和肉制品等為主，應注意低溫保存、盡快食用。烹飪過程中生熟交叉污染、原料不及時冷藏、食材未燒熟煮透等，是引起霍亂、傷寒等腸胃疾病的重要原因，請務必注意烹飪衛生。

南蘇丹報警求助電話777。

在受到侵害、發生火災或者交通事故等緊急情況需要向警方求助時，可撥打南蘇丹報警電話，或向附近巡邏警察、轄區警局、治安點報告，由巡邏警察或值班警察通知相關部門到現場進行處置。發生交通事故、等待警察到場時，保持冷靜和友善態度，勿與當地人發生正面沖突。

遭遇意外需協助時可聯系中國駐南蘇丹使館，使館領保協助電話：00211-912386015，外交部全球領事保護與服務應急熱線（24小時）：+86-10-12308或+86-10-65612308。