空中交通
南蘇丹首都朱巴是南航空樞紐，提供國內、國際民航、貨運和商業包機服務。目前朱巴有往返蘇丹首都喀土穆、埃塞俄比亞首都亞的斯亞貝巴、肯尼亞首都內羅畢、阿聯酋迪拜、烏干達首都坎帕拉、埃及首都開羅、盧旺達首都基加利的國際航班。國內主要城鎮設有簡易機場，運營國內航線。
朱巴國際機場主要國際航線如下：
1、朱巴-內羅畢航線
2、朱巴-亞的斯亞貝巴航線
3、朱巴-喀土穆航線
4、朱巴-迪拜航線
5、朱巴-坎帕拉航線
6、朱巴-開羅航線
7、朱巴—基加利航線
陸路交通
南蘇丹各州間有長途客車，但車輛陳舊，道路多為土路，路況差，雨季期間不少道路無法通行。朱巴至尼穆勒（臨近烏干達的邊境城市）的跨境公路是目前南商品進出口的主要通道。
水路交通
南蘇丹為內陸國，尼羅河是其境內唯一水路航道。內河航運可自朱巴一直北上，直抵蘇丹喀土穆。目前無法通航。
市內交通
南蘇丹首都朱巴無公交系統，僅有民營的各式面包車往返載客，車況差，事故頻發。當地人多選用被稱為“Boda Boda”的個人營運摩托車作為市內交通工具。
主要城市
朱巴：南蘇丹首都，中央政府所在地，同時也是中赤道州首府。人口約50萬，平均海拔457米，距蘇丹首都喀土穆1198公里，距烏干達邊境約180公里，尼羅河流經城市東側。
瓦烏：南蘇丹第二大城市，西加扎勒河州首府，位于朱爾河岸，人口約14萬。瓦烏是南西北地區農產品和畜產品集散地，重要交通樞紐。
責編：小朱
